Klinika infekčních nemocí 3. LF UK sídlí v pavilonu infekčních nemocí ve Fakultní nemocnici Bulovka, Praha 8. Ve stejné budově jsou soustředěny rovněž infekční kliniky 1. LF UK a 2. LF UK, přičemž celý pavilon má společný zdravotnický provoz a z tohoto hlediska funguje jako jeden celek.

V pavilonu infekčních nemocí je poskytována komplexní péče o nemocné s infekčními chorobami, pracoviště jako celek je největší v České republice a má postavení vedoucího pracoviště oboru. V pavilonu působí akutní ambulance, chronická ambulance, speciální ambulance (pro HIV-pozitivní klienty), 6 standardních lůžkových oddělení (z toho dvě pro dětské pacienty) a dvě stanice poskytující intenzivní péči. Kromě toho je zde uzavřená jednotka pro izolaci pacientů s vysoce nebezpečnými importovanými infekcemi typu horečky Ebola.

Hlavní zájmové oblasti kmenových pracovníků Kliniky infekčních nemocí 3. LF UK a FNB:

• MUDr. Hynek Bartoš, Ph.D.: intenzivní péče v infektologii, pneumonie, antibiotika

• prof. MUDr. Jiří Beneš, CSc.: infekční endokarditida, stafylokokové infekce, sepse, antibiotika, klostridiová kolitida

• prof. MUDr. Ladislav Machala, Ph.D.: HIV/AIDS, antivirotika

• doc. MUDr. Olga Džupová, Ph.D.: hnisavá meningitida, život-ohrožující infekční choroby

Doc. Džupová a prof. Beneš jsou členy výboru Společnosti infekčního lékařství ČLS JEP.