Ekonomické oddělení zabezpečuje činnost fakulty zejména tím, že:
1.sestavuje rozpočet fakulty i rozpočet jednotlivých samostatných základních pracovišť a činností a trvale vyhodnocuje jejich plnění,
2.zpracovává finanční plány včetně jejich aktualizace a na jejich základě předkládá vedení fakulty návrhy zásad ekonomického řízení fakulty,
3.zpracovává finanční prognózy, analýzy, kalkulace a výkazy s ekonomickou problematikou,
4.kontroluje dodržování rozpočtové kázně, ostatních obecně závazných právních předpisů i účinnost fakultních ekonomických nástrojů,
5.zajišťuje plnění funkce účetní jednotky za fakultu,
6.vede evidenci majetku fakulty,
7.zajišťuje pokladní službu a platební styk,
8.vystavuje faktury pro odběratele,
9.projednává s bankami veškeré finanční záležitosti,
10.plní funkce hlavního účetního a správce rozpočtu ve smyslu zákona o finanční kontrole,
11.zpracovává návrhy a aktualizace interních předpisů 3.LF UK ve spravované oblasti a po schválení děkanem kontroluje jejich dodržování,
12.vyjadřuje se k investičním potřebám fakulty v rámci své kompetence,
13.připravuje, shromažďuje a zpracovává statistické údaje za spravovanou oblast
14.zodpovídá za problematiku z oblasti daňové, celní a cenové a jejich projednání s příslušnými orgány státní správy a Univerzity Karlovy v Praze.